Fuka Gakuen es un colegio donde se imparte desde primaria hasta los estudios superiores. En Fuka Gakuen existe el rumor de que un misterioso monstruo apareció, y que lo único capaz de hacerle frente eran unas chicas llamadas "HiME"(Highly-advanced Materializing Equipment). Mai fue trasladada a la escuela sin conocer el rumor, aunque rápidamente le dijeron que tenía el poder de una HiME. Después de enfrentarse a diferentes problemas, aprenderá a vivir su vida como una HiME.